微生物實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)中非常重要的一環(huán)就是工作區(qū)域的規(guī)劃。為了防止交叉污染，保護(hù)工作人員的健康，實(shí)驗(yàn)室至少應(yīng)劃分為三個(gè)區(qū)域。即：清潔區(qū)、操作區(qū)和無菌區(qū)。

清潔區(qū)應(yīng)包含辦公等區(qū)域，操作區(qū)應(yīng)配置通風(fēng)柜，保持實(shí)驗(yàn)室內(nèi)溫濕度恒定，且配置供水系統(tǒng)以及廢液處理系統(tǒng)；無菌區(qū)應(yīng)配置潔凈工作臺(tái)，生物安全柜等。

微生物實(shí)驗(yàn)室規(guī)劃設(shè)計(jì)時(shí)，標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)室設(shè)施和必要的防護(hù)設(shè)備是必須的。